病毒/微生物基因组
针对分离纯化后的单一微生物（真核病毒、噬菌体、细菌等）提取基因组，并根据病毒基因组的核酸类型（DNA或RNA）和单双链特点，采用不同的建库方案构建小片段文库，进行高通量测序，然后利用生物信息学方法进行组装、基因预测和功能注释，从而获得其全基因组图谱，进而开展更深入的基因组相关的研究。
靶向单病毒捕获测序分析
产品简介
病毒捕获测序分析（Target virus sequencing）是通过设计合成靶向单一病毒常见亚型的探针或多重引物，杂交捕获或多得扩增病毒序列并进行高通量测序，然后组装病毒全基因组序列，通过生物信息分析不同病毒亚型及变异。
常见捕获病毒：HBV、EBV、HPV、诺如病毒、副流感病毒等
技术路线
杂交捕获：病毒特异性探针设计合成---样本前处理---核酸提取---文库构建---靶向捕获富集---高通量测序---生物信息分析
多重PCR：多重引物设计合成---样本前处理---核酸提取---多重PCR文库构建---高通量测序---生物信息分析
分析内容
【基础版】
(1)基础数据处理
1.原始数据质控
2.去除低质量及接头序列
基因组比对
3.测序数据与宿主基因组及病毒基因组分别比对分析
亚型鉴定
4.病毒基因组组装/一致性序列生成
5.病毒亚型分析
6.病毒SNV分析
【标准版】
(2)整合位点鉴定（可选）
7.病毒整合宿主位点检测
8.病毒断点频率分析
9.病毒整合宿主热点分析
【定制版】
10.根据研究需求定制分析内容
应用方向
临床诊断
特定病毒感染研究
交付标准
数据：1G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准，分别为标准版和定制版。
周期：标准版 50个工作日，其它标准根据样本情况确定。
样品要求
组织：＞100mg，分割成 50 mg 小块后，液氮速冻，-80°保存，干冰寄送。
全血：≥ 1 mL，EDTA 抗凝管采集。
核酸：DNA＞300ng，浓度≥ 10ng/μL，体积≥20ul。
多重PCR对于核酸要求是：浓度>1ng/μl。浓度必须为QUBIT荧光定量法测定，非Nanodrop测定。
CT值要求：目标病毒的Ct值大于31的样品存在无法检出或捕获失败的风险，建议根据实际情况决定是否进行捕获测序。
产品与服务
