三代微生物组
三代微生物组测序分析是指针对特定样品（如粪便、唾液、土壤、水体等）中的微生物群落（含病毒颗粒），提取总基因组 DNA 或富集病毒核酸后，利用 Pacbio/cyclone 高通量测序平台进行超长读长测序，再通过生物信息学方法进行基因组组装，进而分析微生物（含病毒）的序列、丰度、多样性、致病性等信息，以实现微生物群落注释鉴定、新病毒发现等目标的技术体系。该技术通过超长读长优势克服了二代测序读长较短的缺陷，有效提高了基因组组装准确性及微生物群落分析的精准度。
三代宏基因组测序分析
产品简介
三代宏基因组测序分析是指对特定样品中的微生物群落提取总基因组DNA，构建测序文库，然后进行Pacbio/cyclone高通量测序及后续生物信息分析。三代宏基因组测序克服了二代测序读长较短的缺陷，通过测序平台获得的超长读长进行组装，能够有效提高基因组组装的准确性性，使微生物群落注释鉴定更加准确。
技术路线
样本处理---基因组DNA提取 ---文库构建---Pacbio/cyclone测序---生物信息分析
分析内容
[标准分析]
1.原始数据质控，三代数据矫正（pbccs软件）
2.三代数据与宿主基因组比对，污染评估及过滤
3.三代reads的组装及组装结果评估
4.多软件进行序列分箱（Bin），并整合得到最佳分箱结果
5.CheckM对Bin结果进行评估
6.Bin结果注释及丰度计算
7.细菌、古菌、病毒占比分析
8.高质量Bin的抗性基因分析
9.高质量Bin的毒力基因分析
10.差异细菌分析
11.差异细菌的功能预测
[定制化分析]
12.根据研究需求定制分析内容
应用方向
新物种挖掘
功能基因挖掘
微生物与宿主相互作用
交付标准
数据：10G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准，分别为标准版和定制版。
周期：标准版40个工作日，其它标准根据样本情况确定。
样品要求
详细要求，请参考《基因帮样本采集建议》
产品与服务
